Zároveň platí, že minister školstva, vedy, výskumu a športu SR Peter Plavčan má záujem na tom, aby bol proces odborného hodnotenia doručených projektov uchádzajúcich sa o podporu z EÚ zdrojov, do ktorého nijakým spôsobom nezasahoval, preverený. Sám minister školstva Peter Plavčan preto nariadil vykonanie mimoriadneho preverenia výberového procesu schvaľovania Žiadostí o nenávratný finančný príspevok. Zároveň žiada o kontrolu aj Európsku komisiu.
Do ukončenia kontrol bol preto proces schvaľovania pozastavený. Ministerstvo školstva sa nebude vyjadrovať ku priebehu kontrol orgánov na to určených, a to až do ich ukončenia. Činnosť všetkých kompetentných orgánov pri prešetrovaní minister osobne víta.