Hlavnou úlohou NFIU na Slovensku je podpora kolektívnej obrany NATO v plánovacom procese, asistencia pri výcviku a spoločných cvičeniach a v prípade potreby zabezpečenie a koordinácia prijatia spojeneckých síl v danom regióne. „Aj toto je ďalší krok, ktorý prispeje k posilneniu bezpečnosti našej krajiny a jej občanov, čo je pre nás absolútnou prioritou,“ povedal minister obrany SR Peter Gajdoš.
V zodpovednosti jednotky je aj identifikovanie logistických možností a obmedzení, transportných možností, podpornej infraštruktúry tak, aby bolo zabezpečené v prípade potreby čo najrýchlejšie a najplynulejšie nasadenie síl rýchlej reakcie NATO.
NFIU sídli v kasárňach vo Vajnoroch. Od 1. septembra 2016 je oficiálne pod velením Mnohonárodného zboru NATO Sever-východ Štetín.