Program sa sústredí na podporu inovácie a podnikania, ochranu prírodného a kultúrneho bohatstva podunajskej oblasti, zlepšenie prepojenia medzi krajinami ako aj podporu hospodárstva s nízkymi emisiami. Vyčlenené financie môžu okrem Slovenska čerpať Bulharsko, Česká republika, Chorvátsko, Maďarsko, Nemecko, Rakúsko, Rumunsko, Slovensko a Slovinsko a tri krajiny mimo EÚ – Bosna a Hercegovina, Čierna Hora a Srbsko. Na pomoc v rámci tohto programu majú nárok aj Moldavsko a Ukrajina, len čo sa vyrieši financovanie v rámci takzvaného európskeho susedstva.
Prostriedky na program nadnárodnej dunajskej spolupráce pochádzajú z dvoch zdrojov. Viac než 202 miliónov eur je z Európskeho fondu regionálneho rozvoja a skoro 20 miliónov eur z predvstupovej pomoci. Program je súčasťou Dunajskej stratégie Európskej únie, ktorú prijali v júni 2011. „Som rada, že sa prijal tento program. Je navrhnutý tak, aby prostredníctvom svojich tematických priorít a podpory riadenia stratégie EÚ pre podunajskú oblasť priamo prispel k úspešnej realizácii tejto stratégie. Zúčastneným krajinám by mal pomôcť rozvíjať projekty s hmatateľným a pozitívnym dosahom, vďaka ktorým budú môcť aj naďalej zostať atraktívnymi miestami pre život, štúdium, prácu, návštevu a investície,“ povedala komisárka EK pre regionálnu a mestskú politiku Corina Cretu.
